pubchem数据库,化学信息资源的宝库
PubChem数据库是一个由美国国家生物技术信息中心(NCBI)保护的敞开化学数据库,首要支撑有机小分子生物活性数据。以下是关于PubChem数据库的具体介绍:
1. 数据库概述PubChem数据库由美国国立卫生研讨院(NIH)支撑,是一个免费的化学信息资源。自2004年发动以来,它已成为全球数百万科学家、学生和大众的重要化学信息资源。该数据库不只包含小分子,还包含较大的分子,如核苷酸、碳水化合物、脂质、肽和化学修饰的大分子。
2. 数据内容PubChem数据库中记录了很多的化学结构、标识符、化学和物理性质、生物活性、专利、健康、安全、毒性数据等信息。这些数据来源于数百个数据源,包含政府组织、化学品供货商、期刊出版商等。
3. 数据库结构PubChem数据库分为三个子数据库: PubChem BioAssay:存储生化试验数据,首要来自高通量挑选试验和科技文献。 PubChem Compound:存储收拾后的化合物化学结构信息。 PubChem Substance:存储组织和个人上传的化合物原始数据。
4. 检索功用PubChem数据库供给了多种检索方法,首要包含: 关键词检索:支撑输入化合物称号、化学式、CAS号、SMILES码和InChI表达式、基因名等。 结构式检索:经过制作或输入化学结构进行检索。 批量检索:答运用户上传多个化合物称号或ID进行批量查询。
5. 运用方法 拜访用户能够经过拜访PubChem的官方网站(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)直接进行数据检索。 API和Python库:PubChem还供给了PUG REST API,用户能够经过编程方法查询和下载数据。此外,Python库PubChemPy能够协助用户更方便地运用PubChem数据库。
6. 运用范畴PubChem数据库在生物医药、生物化学、环境科学等范畴有广泛的运用。科研人员能够经过该数据库查询化合物的结构、理化性质、生物活性、毒性和安全性数据,以及相关的文献和专利信息。
期望以上信息对您了解和运用PubChem数据库有所协助。如需进一步了解,能够拜访PubChem的官方网站或相关教程。
深化探究PubChem数据库:化学信息资源的宝库
在化学研讨范畴,具有丰厚的化学信息资源关于科研人员来说至关重要。PubChem数据库作为全球闻名的化学信息资源之一,为科研人员供给了很多的化学物质信息。本文将具体介绍PubChem数据库的特色、运用方法以及怎么最大化运用这一资源。
一、PubChem数据库简介
PubChem数据库是由美国国立卫生研讨院(NIH)部属的美国国家生物技术信息中心(NCBI)保护的一个免费化学信息资源。该数据库包含了超越1亿种化学物质的信息,包含化学结构、物理化学性质、生物活性、文献引证等。PubChem数据库旨在为全球科研人员供给快捷的化学信息查询服务。
二、PubChem数据库的三大子数据库
PubChem数据库由三个子数据库组成,分别是:
PubChem BioAssay:存储生化试验数据,首要来自高通量挑选试验和科技文献。
PubChem Compound:存储收拾后的化合物化学结构信息。
PubChem Substance:存储组织和个人上传的化合物原始数据。
三、PubChem数据库的运用方法
1. 查找化学物质
在PubChem的主页面,你能够经过以下方法查找化学物质:
输入化学称号或分子式:在查找框中输入化学物质的称号、分子式、CAS号等信息,PubChem会主动识别并显现相关化学物质。
运用高档查找功用:点击查找框周围的高档查找按钮,能够依据分子量规模、物理化学性质、供货商信息等特点进行过滤查找。
结构查找:经过制作化学结构或上传结构文件进行查找,PubChem会依据供给的结构图谱主动匹配数据库中的化学物质。
2. 获取化学信息
找到方针化学物质后,你能够获取以下具体信息:
物理化学性质:包含分子量、沸点、熔点、溶解度等。
化学性质:包含分子式、结构式、同分异构体等。
生物活性:包含靶点、效果机制、生物活性数据等。
文献引证:与该化学物质相关的文献信息。
四、PubChem数据库的运用
化合物挑选:经过PubChem数据库,科研人员能够快速挑选具有特定生物活性的化合物。
药物研制:PubChem数据库为药物研制供给了丰厚的化学信息资源,有助于发现新的药物靶点和先导化合物。
生物信息学:PubChem数据库为生物信息学研讨供给了很多的化学数据,有助于解析生物分子之间的相互效果。
PubChem数据库作为全球闻名的化学信息资源,为科研人员供给了丰厚的化学物质信息。经过把握PubChem数据库的运用方法,科研人员能够更高效地获取化学信息,为科学研讨供给有力支撑。
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