cosmic数据库,癌症体细胞骤变研讨的强壮东西
COSMIC(Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer)数据库是癌症基因组学研讨中的重要资源,由英国威康信任基金会桑格研讨所(Wellcome Trust Sanger Institute)开发和保护。以下是关于COSMIC数据库的具体介绍、用处和运用方法:
介绍COSMIC数据库是一个全面记载人类癌症体细胞骤变的目录。它包含很多的基因骤变、基因组重排、拷贝数变异和药物反抗骤变等数据。数据库中的数据首要来历于文献搜集和收拾,而且每季度进行更新,以坚持数据的最新性。
用处1. 骤变数据查询:COSMIC数据库供给了丰厚的骤变数据,包含点骤变、基因交融、拷贝数变异等,研讨人员能够通过这些数据了解不同癌症类型中的骤变特征。2. 癌症类型信息获取:数据库中具体记载了各种癌症类型的骤变数据,有助于研讨人员剖析特定癌症的遗传异质性。3. 基因和骤变频率剖析:通过COSMIC,研讨人员能够剖析特定基因或骤变的频率,然后了解其在癌症产生和开展中的效果。4. 数据下载和可视化:COSMIC供给了数据下载功用,答应研讨人员下载具体的骤变位点信息,并运用可视化东西进行剖析。5. 支撑基础研讨和临床运用:COSMIC数据库为癌症的基础研讨和临床运用供给了详实的骤变数据,支撑药物开发和医治靶点的确认。
运用方法1. 数据查询:用户能够通过COSMIC的在线渠道查询特定基因、癌症类型或骤变信息。2. 数据下载:COSMIC供给了数据下载功用,用户能够下载具体的骤变位点信息,包含GRCh37/GRCh38基因组坐标、HGVS编号、氨基酸改变等。3. 数据剖析:用户能够运用COSMIC供给的东西进行基因和骤变频率的剖析,支撑研讨工作的深化。4. 可视化东西:COSMIC供给了可视化东西,协助用户更直观地了解骤变数据。
其他项目 COSMIC3D:这是一个新的东西,将序列的骤变数据与蛋白质结构数据库衔接,便于进行结构、功用和药物性剖析。 Cancer Gene Census :记载了与人类癌症具有强根据等级的基因,最新版别包含了719个基因,并记载了基因对疾病病因的奉献。
通过以上介绍,希望能协助您更好地了解和运用COSMIC数据库。假如需求进一步的信息或有具体问题,请随时联络。
COSMIC数据库:癌症体细胞骤变研讨的强壮东西
COSMIC数据库,全称为Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer,是癌症研讨范畴中不可或缺的数据库之一。它为全球的研讨人员供给了一个全面、威望的癌症体细胞骤变信息资源。
一、COSMIC数据库的来历与开展
COSMIC数据库于2004年2月4日由英国威康信任基金会桑格研讨所(Wellcome Trust Sanger Institute)初次发布。自那时起,该数据库不断开展壮大,至今已更新至第91个版别(v91)。COSMIC数据库的树立,旨在搜集和展现人类癌症中发现的体细胞骤变信息,为癌症研讨供给有力支撑。
二、COSMIC数据库的数据来历
COSMIC数据库的数据首要来历于以下几个方面:
科学文献中的论文:数据库收录了超越27,000篇同行评定的科学论文,涵盖了癌症体细胞骤变的研讨成果。
大规模基因组筛查数据:数据库整合了超越37,000个基因组的信息,包含TCGA和ICGC等数据库供给的数据。
专家手艺挑选和收拾的数据:数据库中的数据通过专家手艺挑选和收拾,确保了数据的准确性和可靠性。
三、COSMIC数据库的功用与特色
COSMIC数据库具有以下功用和特色:
全面性:数据库收录了来自全球多个研讨机构和数据库的癌症体细胞骤变数据,为研讨人员供给了全面的信息资源。
准确性:数据库中的数据通过专家手艺挑选和收拾,确保了数据的准确性和可靠性。
易用性:数据库供给了便利的阅读、检索和下载功用,用户能够轻松获取所需信息。
更新及时:数据库每年进行四次重要更新,以捕获和供给新的、具有潜在含义的数据。
四、COSMIC数据库的运用
COSMIC数据库在癌症研讨范畴具有广泛的运用,首要包含以下几个方面:
基因功用研讨:研讨人员能够使用COSMIC数据库了解特定基因在癌症中的骤变状况,然后研讨基因的功用和效果机制。
药物研制:COSMIC数据库中的骤变数据有助于药物研制人员挑选和评价潜在的医治靶点。
个体化医疗:COSMIC数据库中的骤变数据能够为个体化医疗供给根据,协助医师为患者拟定更精准的医治计划。
COSMIC数据库作为癌症体细胞骤变研讨的强壮东西,为全球的研讨人员供给了名贵的信息资源。跟着数据库的不断更新和完善,COSMIC数据库将在癌症研讨范畴发挥越来越重要的效果。
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